内阁的批复很快到了张居正等人的案头，同时还有免去胡宗宪浙直总督的诏书，对于免去他浙直总督，胡宗宪早就有准备了，毕竟胡宗宪就是一把刀，现在人杀完了，刀自然是要收起来的。
胡宗宪领旨谢恩之后，飘然而去。
而张居正和杨继盛、蔡国熙、沈炼等人，一面征缴赋税，一面详细查看苏州、松江两府各县的实际情况，为析县作准备。
关于苏州的析县，其实基本上是准备按照徐阶的设想来进行，分长洲县南部设元和县；从常熟县分出昭文县，从吴江县分出震泽县，从昆山县分出新阳县，这样苏州府就有十一县了，同时将太仓州升为直隶州，治镇洋县，辖常熟、昭文、镇洋、昆山、新阳五县。
同时将原属苏州府管辖的崇明县划给松江府管理，原由苏州代管的启东县也划给江北的南通州管辖，这样一来苏州现在的辖区就完全在江南了，没有江北的辖区，也方便苏州府管理辖区各县。
但是松江的情况就要复杂一些，松江府存在一个金山卫，还有大量的实土卫所，州县怎么和卫所相处是一个问题，还有就是松江府位于长江入海口，受长江携带的泥沙影响，现在的松江府，辖区比之大明初年要多了不少，这些多出来的土地，应该怎么划分，也是一个问题。
为此，张居正和杨继盛等人亲自前往上海，实地查看松江府下辖各县的情况，经过实地查看之后，张居正等人拟定了新的析县方案，析华亭县，新设娄县，新设奉贤县、金山县、南汇县和福泉县，同时建议升上海县为上海州，辖上海、崇明、南汇三县。
这样一来，松江府就下辖华亭、娄县、上海县、青浦县、崇明县、奉贤县、金山县、南汇县和福泉县九县及上海州，大致和苏州府差不多，但是徐阶提出一个看法，就是将苏州府的嘉定县划给松江府，这样松江府就和苏州府一样都是十县了。
但是徐阶的这个建议遭到了蔡国熙的坚决反对，因为嘉定在苏州也算富县，而且嘉定素称教化之邦，就算是在科举鼎盛的苏州，嘉定也算是非常厉害的，而且嘉定一向就归苏州管，怎么能上来就划给松江府呢。
张居正也无法决断此事，只能将此事上奏朱载
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